ПРИКАСПИЙСКИЙ ЖУРНАЛ

УПРАВЛЕНИЕ И ВЫСОКИЕ ТЕХНОЛОГИИ

Структурно-динамические модели гидроксицитозинов

Читать Элькин Михаил Давыдович, Смирнов Владимир Вячеславович, Джалмухамбетова Елена Азатуллаевна, Алыкова Ольга Михайловна, Гайсина Альфия Рафаилевна, Коломин Валентин Ильич, Равчеева Наталья Александровна Структурно-динамические модели гидроксицитозинов  // Прикаспийский журнал:  управление и высокие технологии. — 2013. — №1. — Стр. 102-111.

Элькин Михаил Давыдович - доктор физико-математических наук, профессор, Астраханский государственный университет, 414056, Российская Федерация, г. Астрахань, ул. Татищева, 20а, тел. 8 (8512) 61-08-84,, elkinmd@mail.ru

Смирнов Владимир Вячеславович - кандидат физико-математических наук, доцент, Астраханский государственный университет, 414056, Российская Федерация, г. Астрахань, ул. Татищева, 20а, тел. 8 (8512) 61-08-84,, elkinmd@mail.ru

Джалмухамбетова Елена Азатуллаевна - кандидат физико-математических наук, доцент, Астраханский государственный университет, 414056, Российская Федерация, г. Астрахань, ул. Татищева, 20а, тел. 8 (8512) 61-08-84,, elena_jalm@mail.ru

Алыкова Ольга Михайловна - кандидат педагогических наук, доцент, Астраханский государственный университет, 414056, Российская Федерация, г. Астрахань, ул. Татищева, 20а, тел. 8 (8512) 61-08-84, e-mail: elkinmd@mail.ru, elkinmd@mail.ru, kof@aspu.ru

Гайсина Альфия Рафаилевна - ассистент, Астраханский государственный университет, 414056, Российская Федерация, г. Астрахань, ул. Татищева, 20а, тел. 8 (8512) 61-08-84,, gaisinaalfiya@mail.ru

Коломин Валентин Ильич - доктор педагогических наук, профессор, Астраханский государственный университет, 414056, Российская Федерация, г. Астрахань, ул. Татищева, 20а, тел. 8 (8512) 61-08-84,, kof@aspu.ru

Равчеева Наталья Александровна - магистрант, Астраханский государственный университет, 414056, Российская Федерация, г. Астрахань, ул. Татищева, 20а, тел. 8 (8512) 61-08-84,, kof@aspu.ru

Цитозин относится к азотистым основаниям нуклеиновых кислот. Его соединения могут существовать в различных таутомерных формах. Одной из них являются гидроксицитозины при замене фрагмента С=О гидроксильной группой ОН. В работе представлены результаты модельных расчетов структуры и спектра возможных таутомеров мономеров и димеров гидроксицитозина. Исследование осуществлено в рамках метода функционала плотности DFT/b3LYP с учетом ангармонизма колебаний. Согласно полученным результатам, значения геометрических параметров валентных связей и валентных углов пиримидинового кольца определяются только типом таутомера. Вид конформера определяет значение валентных углов A(NCO), A(NCN). Наиболее интенсивными являются полосы в диапазоне выше 1000 см-1. Они интерпретированы как колебания валентных связей (Q) и валентных углов (?) шестичленного пиримидинового кольца, деформационные колебания связей СН (?), NH (?NH и ?NH’). Для идентификации конформеров конкретного таутомера можно использовать как интенсивность соответствующих полос, так и возможный их сдвиг, достигающий ~ 50 см-1. Характер проявления валентных колебаний связей ОН гидроксильного фрагмента хорошо согласуется с имеющимися данными.

Ключевые слова: цитозин,гидроксицитозин,димер,колебательные спектры,молекулярные спектры,ИК спектры,ангармонизм колебаний,адиабатический потенциал,силовые постоянные